【Chem. Sci.】芳香侧链翻转影响人源组蛋白脱乙酰酶8功能环的构象

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人源组蛋白脱乙酰酶8HDAC8)是基因调控中的关键水解酶,是重要的药物靶点。目前,已解析了高分辨率HDAC8与底物或抑制剂配体的晶体结构,这为深入了解HDAC8的结合态及其功能提供了基础。

图片来源:Chem. Sci.


近期,英国伦敦大学学院D. Flemming Hansen组利用长全原子无偏分子动力学模拟(all-atom unbiased molecular dynamics simulations)和马尔可夫状态模型(Markov state modelling),证明了活性位点附近芳香侧链构象与HDAC8周围功能环的开闭之间存在着很强的相关性。 


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此外,该报道还研究了两个已知的变构HDAC8酶活性下调的突变体I19SS39E。实验结果显示,推测突变体I19S-HDAC8不能释放产物,而S39E-HDAC8突变体中的产物释放和底物结合都受到损害。这些结果为HDAC8的功能动力学提供了详细的见解,并提供了变构突变(包括致病突变)引起的实质性下调的机制。

图片来源:Chem. Sci.


参考文献:Aromatic side-chain flips orchestrate the conformational sampling of{attr}3106{/attr} loops in human histone deacetylase 8

Chem. Sci.

DOI: 10.1039/d1sc01929e

原文作者:Vaibhav Kumar Shukla,‡ Lucas Siemons,‡ Francesco L. Gervasio and D.Flemming Hansen*


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