Cell | 利用光遗传学技术发现综合应激反应的调节剂

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分享一篇发表在cell上的文章:Optogenetics-enabled discovery of integrated stress response modulators,通讯作者是来自加州大学圣塔芭芭拉分校的Maxwell Z. Wilson教授,MIT的James J. Collins教授以及他的博后Felix Wong。Wilson的研究方向是利用生物学、工程学和物理学的工具来理解细胞的感知场;而Collins的研究方向是合成生物学。

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综合应激反应ISR)是一种保守的应激反应,可维持真核细胞的体内平衡。这些应激因子通过四种应激传感器激酶(HRI、PKR、PERK和GCN2)检测,它们通过eIF2α的磷酸化调控翻译,表达下游的ATF4和其它ISR成分,最终发生适应性反应(抑制蛋白合成或者促进细胞凋亡)。调节ISR对病毒感染、癌症和神经退行性病变等疾病具有治疗潜力,但是,很少有已知化合物可以在没有毒性的情况下做到这一点。

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为了应对这一挑战,本文作者希望能开发一个光遗传学平台,用于发现选择性调节ISR的化合物。首先,作者在前期研究中证明了PKR的生理激活依赖于它的寡聚化,并且可以将PKR的双链RNA结合结构域(dRBM1和dRBM2)替换为光遗传学模块Cry2Olig。该光遗传系统(opto-PKR)在暴露于蓝光时触发PKR相分离,模拟PKR的自然激活并诱导ISR,而不会产生与小分子应激源相关的通路外细胞毒性。由于这种活化ISR的方式没有其它毒性,作者认为该光遗传学工具可以用于筛选ISR的小分子调节剂。

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随后,作者将opto-PKR表达在细胞中,并对含有370,830个小分子的化合物库进行了基于表型的筛选,看看哪些化合物能调节ISR。作者使用10 μM的浓度,在各种化合物存在的情况下,光照24 h后测量细胞存活率。与此同时,还在对照组细胞中,进行了细胞毒性的反向筛选。

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通过高通量的筛选,作者发现了一类化合物在浓度高达50 μM时,在黑暗中对opto-PKR细胞没有急性细胞毒性,但在光照下EC50值为~ 0.1至~1 μM,具有非常强的选择性。进一步地,作者证明了它们能够消除不同应激源中高度ISR的细胞,并且通过机制研究,证明了这些化合物上调ATF4,使得细胞对应激和凋亡敏感,并确定GCN2为这些分子的靶点。此外,作者还在小鼠中证明了这些分子具有抗病毒活性。

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总而言之,本文作者针对ISR开发了一种光遗传学方法,结合高通量筛选的方法来筛选调节剂。


本文作者:MB

责任编辑:LZ

DOI:10.1016/j.cell.2025.06.024

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.06.024


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