在酸性水解条件下TBDPS保护基比TBDMS更加稳定（约 100 倍），而TBDPS保护基对碱的稳定性比TBDMS要差。另外，由于该保护基的分子量较大，容易使底物固化而易于分离，TBDPS保护基对许多与TBDMS保护基不相容的试剂显出比TBDMS基团更好的稳定性。TBDMS基团在酸性条件下不易迁移。TBDPS醚对K2CO3 /CH3OH，对 9M 氨水、60℃、2h；对MeONa（cat.）/CH3OH、25℃、24h均稳定。该醚对 80%乙酸稳定，后者可用于脱除醚中TBDMS，三苯甲基，四氢吡喃保护基也对HBr /AcOH，12℃，2min；对 25%~75%甲酸，25℃，2h~6h；以及 50%三氟乙酸，25℃，15min稳定。 

通过 TBDPSCl 进行羟基的叔丁基二甲基硅醚保护示例

    To a solution of 1,4-butanediol (5 g, 55 mmol) in CH2Cl2 (10 mL) containing i-Pr2NEt (10 mL) was added t-BDPSiCl (5 mL, 18 mmol) dropwise under N2 at 22-24oC. The solution was stirred at 22-24oC for 2 h, concentrated in vacuo and chromatographed, eluting with 

hexanes/ethyl acetate (10:1) to 2 (clear oil, 5.6 g, 95%).