ACS Chem. Biol. | 在大肠杆菌中利用 B12 依赖的脱卤反应来实现有机卤的生物降解

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近期发表在 ACS Chemical Biology 的文章,本文的题目是“Sustainable B12-Dependent Dehalogenation of Organohalides in E. coli本文的核心是作者们通过对一系列的钴胺B12)依赖性还原去卤酶进行了筛选,找到了能够降解某些含卤有机物的酶。本文的通讯作者是来自哈佛医学院的 Tai L. Ng

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农业和工业排放的人为污染物对野生动植物造成伤害,也对人类健康构成威胁。生物修复是充分地利用自然界中的微生物,在受污染的土壤、地下水和污水处理厂等各种环境中降解污染物。然而,随着工业和科技的进步,近几十年有许多新型的有机分子被释放到自然界中。为了提高生物降解速率,可以将一组酶有针对性地组装成合成降解途径。


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自然界中,有依赖于卤素生长的细菌,这些细菌中的B12依赖性还原去卤酶(RDases)是一个吸引人的选择,可以将其纳入工程生物修复途径。考虑到许多难降解的小分子污染物都含有大量卤素,例如,氯化联苯(PCBs)与较少卤化同分异构体相比,在体内更容易生物富集,并且抵抗环境氧化。RDases 结合B12,并在具有催化活性的Co(III/II/I)中还原裂解碳-卤键,形成C−H键。这些酶的C端包含多达两个铁-硫簇,通常是[4Fe-4S],用于接受从H2或有机酸传递来的电子。
传统上,B12-RDases的研究通常建立在那些生长缓慢的依赖有机卤素呼吸细菌中,但是这些细菌生长极为缓慢。因此,从天然菌株中纯化这些蛋白是非常费时费力的,并且,许多异源表达的蛋白质是不溶解的。


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本文作者们在大肠杆菌中表达了 42 个钴胺(B12)依赖性还原去卤酶,找到了能够降解卤代乙烯的去卤化酶 RdhH2,RdhC1 和 RdhF3。随后,作者们找到了将 2,4,6-三碘苯酚逐步还原为二碘苯酚、一碘苯酚和苯酚的还原酶。最后,作者们想到可以对大肠杆菌的进行工程化改造,让其以无害的成分为底物,利用这些还原去卤酶来降解自然界中的有机卤。作者们就利用来自 Desulfovibrio africanus 丙酮酸为底物的丙酮酸:铁氧还蛋白氧化还原酶,电子从丙酮酸经由 Flavodoxins 酶最后传递到还原去卤酶上,还原有机卤的碳-卤键,形成C−H键。
本文作者:Zihua Liu
责任编辑:ZJ
原文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.3c00585
文章引用:10.1021/acschembio.3c00585

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